Герб Шенкурска высочайше утвержден 2 октября 1780 года вместе с другими гербами Вологодского наместничества (в тексте ПСЗ РИ, № 15069, стоит дата 2.10.1780 г., но на листе с рисунками - 2.10.1781 г.).

"Шенкурска. Зверек, называемый барсук, в зеленом поле, которых в окрестностях сего города много находится".
В верхней половине щита помещался герб Вологды, т.к. "...При сочинении же оных (гербов) за правило поставлено, чтоб во всяком гербе Вологодского Наместничества в щите была часть из герба Наместнического города, по примеру прежде уже апробированных Вашим Императорским Величеством гербов..."

Использованы материалы статей О.Рево в журнале "Наука и жизнь" №6, 1982 и ПСЗ РИ.
изображение герба выполнено по книге Н.Н.Сперансова "Земельные гербы России". Справа - цветной рисунок из подносного экземпляра для имп. Александры Федоровны "Книги чертеже и рисунков, содержащей гербы городов", 1830-е; из фондов РНБ.

Позже, возможно, существовал неофициальный герб Шенкурска с Архангельским гербом в верхней части.

Современная прорисовка Ю.Калинкина (г.Долгопрудный). Справа - изображение герба Шенкурска на карте Архангельской губернии 1844 года

В коллекции Архангельского краеведческого музея хранится Альбом с рисунками гербов губернии ориентировочно 1870-х годов. Герб Шенкурска из этого альбома.

По сообщению И. Афонасенко

14 июля 1859 года датирован проект герба Шенкурска: "В зеленом поле золотой барсук. В вольной части герб Архангельской губернии. Щит положен на золотые лежащие накрест молотки, соединенные Александровской лентой".

Материалы архива В.Маркова (г.Санкт-Петербург), рисунок восстановлен по значку Кишиневского ЭМЗ

Геральдистом-энтузиастом С.А.Акатовым выпускался сувенирный значок с такой эмблемой г. Шенкурск (авт. дат. проекта - 1980 г.; реализация в виде значка - кон. 90-х - нач. 2000-х). Парусный корабль в данном случае - общая эмблема Архангельской области. Этот вариант эмблемы не использовался и не утверждался официально.

Материалы геральдического архива В. Маркова.

Положение о гербе Шенкурского района утверждено Решением Собрания депутатов района от 9 октября 2009 года №38. Герб внесен в Государственный геральдический регистр под №5829. Согласно тексту Положения о гербе:

"3. Геральдическое описание и расшифровка символики герба муниципального образования «Шенкурский муниципальный район»
3.1. Геральдическое описание герба муниципального образования «Шенкурский муниципальный район» гласит: В зеленом поле идущий серебряный с черными глазами, носом, полосой на морде, брюхом и лапами барсук. В вольной части герб Архангельской области. Щит увенчан муниципальной короной установленного образца.
3.2. Расшифровка символики герба муниципального образования «Шенкурский муниципальный район»: герб муниципального образования «Шенкурский муниципальный район» создан на основе исторического герба города Шенкурска, высочайше утвержденного 02 октября 1781 года.
Барсук на зеленом фоне из герба города Шенкурска – это зверек, обитающий в окрестностях сего города в большом количестве.
Зеленый цвет гербового поля символизирует изобилие, плодородие, радость, свободу, покой и мир.
Серебро – символ веры, чистоты, искренности, благородства, откровенности.
Черный цвет – символ образованности, скромности.
Герб Архангельской области, помещенный в вольной части (в верхнем правом углу) указывает на территориальную принадлежность к Архангельской области.
4. Порядок воспроизведения герба муниципального образования «Шенкурский муниципальный район»
4.1. Воспроизведение официального герба муниципального образования «Шенкурский муниципальный район», независимо от его размеров и техники исполнения, должно точно соответствовать геральдическому описанию, приведенному в пункте 3.1. настоящего Положения и общим геральдическим нормам. Допускается изображение герба в одноцветной версии, с использованием условной геральдической штриховки для обозначения цветов или же без неё.
4.2. Допускается воспроизведение герба муниципального образования «Шенкурский муниципальный район» в сокращенном виде без одного или нескольких структурных элементов дополняющих щит (то есть без вольной части).

Материалы официального сайта МО "Шенкурский муниципальный район"

В 2022 году Шенкурский муниципальный район преобразован в Шенкурский муниципальный округ (все сельские поселения в его составе утратили муниципальный статус). При этом район как административно-территориальная единица сохранен.