Герб района утверждён Решением Пустошкинского районного Собрания депутатов Псковской области от 29 мая 2000 года "О гербе Муниципального образования "Пустошкинский район". Официальное описание герба Пустошкинского района:

"В зеленом поле пониженный золотой узкий крест с косвенными верхним и нижним плечами, заполненный лазурью (синим, голубым) в нижнем правом углу и в оконечности, а поверх всего, стоящий на одной ноге на перекрестье серебряный аист с черными концами сложенных крыльев и глазами, с червлеными (красными) клювом и ногами".
Символика герба:
Основой герба, его фундаментом стало географическое расположение города Пустошка, который расположен на пересечении транспортных магистралей: Москва - Рига и Санкт-Петербург - Киев. Зеленый цвет показывает леса, поля и сельскохозяйственные угодья района. Зеленый цвет также символ плодородия, надежды и здоровья. Синий цвет отражает многочисленные озера, находящиеся на территории района. Синий цвет - символ чистоты неба, красоты и добродетели. Аисты, гнездящиеся в этих местах, являются символом города. Аист символизирует мир, почтительность к родителям и чистоту природы. Серебро в геральдике - символ простоты, совершенства, мудрости, благородства, мира, взаимосотрудничества. Золото - символ прочности, величия, богатства, интеллекта, великодушия. Красный цвет - символ праздника, красоты, радости. Черный цвет в геральдике символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность и вечность бытия.

Авторы герба: Константин Моченов (г.Химки), Владимир Медведев (г.Пустошка), Александр Фадеенков (г.Пустошка), Николай Сайков (Пустошкинский район); художник: Роберт Маланичев (г.Москва). Компьютерный дизайн: Сергей Исаев (г. Москва).

По информации М.В.Ревнивцева со ссылкой на правовую базу "ГАРАНТ"

По другим данным автор герба - Э.Ф.Кравцов (возможно, имеется в виду, что прорисовка для оформления районной администрации выполнена Э.Кравцовым ?). Герб внесен в Государственный геральдический регистр под №650

Использованы материалы сайта HTTP://WWW.PYSTOSHKA.H10.RU

Некоторое время существовало единое муниципальное образование "Пустошкинский район и город Пустошка". Но к 2007 году город и район составили два различных муниципальных образования. В связи с чем Решением Собрания депутатов Пустошкинского района Псковской области от 29 июня 2007 года №20 ("О гербе муниципального образования "Пустошкинский район") было решено считать бывший герб Пустошкинского района и города Пустошка гербом Пустошкинского района. Соответствующим образом было изменено Положение о гербе. В Положении также сказано, что "Герб Пустошкинского района может воспроизводиться в двух равнодопустимых версиях:
- без вольной части;
- с вольной частью - четырехугольником, примыкающим изнутри к верхнему краю герба Пустошкинского района с воспроизведенными в нем фигурами герба Псковской области.
Версия герба с вольной частью применяется после соответствующего законодательного закрепления порядка включения в гербы муниципальных образований Псковской области вольной части с изображением герба Псковской области.
Герб Пустошкинского района в соответствии с протоколом заседания Геральдического совета при Президенте Российской Федерации от 23-24 марта 2005 г. N 24 пункт 8 может воспроизводиться со статусной короной установленного образца".

В 2007 году герб перерегистрирован в Государственном геральдическом регистре.

Текст документа от В. Маркова