Муезерский район образован в 1966 году. В 1998 году в граниыах района создано одноименное муниципальное образование "Муезерский район". В 2004 году муниципальное образование в границах района получило статус муниципального района. В состав муниципального района входили муниципальные образования: Муезерское городское поселение и сельские поселения Воломское, Ледмозерское, Лендерское, Пенингское, Ребольское, Ругозерское, Суккозерское. Республиканским законом от 21.04.2025 года Муезерский муниципальный район преобразован в Муезерский муниципальный округ. При этом все городские и сельские поселения утратили муниципальный статус.

Проект герба Муезерского района Карелии.

Изображение герба предоставлено А.Хениненом, HENINEN.NET

Цветной рисунок выполнен для "Геральдикума" Ю.Калинкиным