Герб Холмогойского СП утверждён Решением Думы муниципального образования «Холмогойское сельское поселение» от 27 февраля 2018 г. № 5

"В золотом поле дугообразное червлёное (красное) сияние над зелёной горой с тремя вершинами, средняя из которых ниже крайних. Гора обременена коронованной с зелёным глазом и червлёным (красным) языком золотой змеёй, расположенной промеж двух золотых елей. Снизу гора ограничена расположенным в оконечности тонко окаймлённым серебром лазоревым (синим, голубым) поясом, сопровожденным внизу в зелени двумя противообращёнными золотыми колосьями, положенными в пояс.

Волнистый пояс - река Залари; «Холмогой» от бурятского «могой»-змея; три вершины - три поселения в составе муниципального образования, холмистая местность; ели - хвойные леса; колосья - выращивание зерновых.

Герб внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 11836.

По сообщению В. Маркова