Боготольский район образован в 1924 году в составе Западно-Сибирского края. В 1951 г. город Боготол выделен из состава района. В 2005 году муниципальное образование в пределах Боготольского района получило статус муниципального района, в его составе образованы городское поселение город Иланский и несколько сельских поселений. Законом Красноярского края от 21 ноября 2024 года Боготольский муниципальный район преобразован в Боготольский муниципальный округ. Все муниципалитеты первого уровня в границах района при этом упразднены. Законом Красноярского края от 15 мая 2025 года Боготольский муниципальный округ, городской округ город Боготол и Тюхтенский муниципальный округ преобразованы в укрупненный Боготольский муниципальный округ.

Решением Боготольского районного Совета депутатов № 57-409 от 26 января 2010 года утвержден герб Боготольского района.

В червленом щите с зеленой облаковидной, окаймленной серебром оконечностью золотая подкова концами вверх, сквозь которую проходят две серебряные стрелы, положенные в левую перевязь. Верхняя стрела обращена острием влево, нижняя стрела обращена острием вправо. Подкова сопровождается сверху золотой, обращенной прямо птицей с поднятыми крыльями.

Червленый (красный) цвет — основной цвет герба Красноярского края, а также герба города Боготола, его использование символизирует культурно-историческое единение Боготольского района с другими муниципальными образованиями края.
Зеленый цвет — символ надежды, изобилия, а также природных ресурсов района. Серебряная (белая) облаковидная (волнообразная) лента, отделяющая оконечность, отражает географическую особенность реки Чулым, протекающей по территории района.
Золотая (желтая) подкова с серебряными противообращенными стрелами символизирует Сибирский тракт — основную историческую транспортную магистраль, создавшую основу для хозяйственного и культурного развития территории.
Золотая (желтая) птица является полугласным символом и обозначает название Галкинского прииска — предприятия золотодобычи, являющегося в свое время одним из основных источников богатства и благополучия жителей территории.

Авторская группа: А. Журавков, Н. Красько, М. Катаровский.

Источник - http://my.krskstate.ru/docs/heraldika/gerb-i-flag-bogotolskogo-rayona/

Герб внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 5967.