Район до 2016 года именовался "Котовский", а его административный центр - "город Котовск".

Герб Подольского района утвержден Решением Подольского районного совета от 28 февраля 2023 года № 197-VIII.

Герб района представляет собой прямоугольный щит с закругленными нижними углами, с соотношением ширины и высоты 5:6. На зеленом поле золотой цветок подсолнечника в виде солнца, который сопровождается внизу двумя золотыми колосьями накрест. В красном основании, звершенном серебряной волнистой окантовкой - золотое железнодорожное колесо с крыльями. Щит размещен в золотом картуше, верхняя половина которого эклектичная, а нижняя создана из колосьев и винограда. Щит увенчан золотой территориальной короной. Под щитом на зеленой ленте, подбитой золотом, золотыми литерами написано "ПОДIЛЬСЬКИЙ РАЙОН".

Подсолнух символизирует свет, добро, достаток, южный край. Крылатое колесо характеризует Подольск как районный центр и железнодорожный узел. Колос - эмблема плодородия и жизненной силы. Серебряная волнистая полоса символизирует реки и водоемы региона.

Материалы геральдического архива В. Маркова