В 1944 году создан Куноватский сельсовет, в 1976 году переименованный в Лопхаринский. Муниципальное образование образовано в 2004 году, тогда же оно получило статус сельского поселения. На территории МО расположены села Лопхари, Казым-Мыс, Сангымгорт. В 2022 году при преобразовании Шурышкарского (муниципального) района в муниципальный округ Лопхаринское МО упразднено.

Герб МО Лопхаринское утвержден решением Собрания депутатов муниципального образования Лопхаринское от 22 октября 2009 года №110 и внесен в Государственный геральдический регистр РФ под №5755. Описание герба:

"В зеленом поле с правым лазоревым краем - стоящий серебряный журавль с червлеными лапами и таковым же поднятым вверх раскрытым клювом, с воздетыми крыльями, на концах которых черные маховые перья; держащий в правой лапе поверх границы края золотое, с Т-образной рукоятью, весло лопастью вниз".

Герб муниципального образования Лопхаринское в соответствии с Законом Ямало-Ненецкого автономного округа от 13 октября 2003 г. № 41-ЗАО (Статья 6, пункт 3) "О гербе Ямало-Ненецкого автономного округа", может воспроизводиться в двух равнодопустимых версиях:
- с вольной частью - четырехугольником, примыкающим к верхнему и левому краю герба муниципального образования Лопхаринское с воспроизведёнными в нем фигурами гербового щита Ямало-Ненецкого округа;
- без вольной части.
Герб муниципального образования Лопхаринское в соответствии с Методическими рекомендациями по разработке и использованию официальных символов муниципальных образований (Раздел 2, Глава VIII, п.п. 45-46), утвержденными Геральдическим советом при Президенте Российской Федерации 28.06.2006 года может воспроизводиться со статусной короной установленного образца.

Обоснование символики герба муниципального образования Лопхаринское.
Лопхаринское муниципальное образование, расположенное на юге Шурышкарского района Ямало-Ненецкого автономного округа, объединило на своей территории большое количество юрт, гортов, летовий и зимовий. Три современных населенных пункта входящих в состав муниципального образования, образованы именно из временных мест рыбалки, стойбищ и т.п. По рассказам старожилов, на месте нынешних Лопхарей жители изготавливали лодки - калданки и весла. Это обстоятельство и послужило появлению названия села Лопхари - "место, где изготавливали весла". Изображение весла в гербе муниципального образования Лопхаринское указывает на название и делает, таким образом, композицию герба гласной.
Природа в этом месте отличается чистотой и разнообразием. В местных лесах водится в большом количестве соболь, лось, боровая дичь. В реках - ценные породы рыбы - Нельма и муксун, встречается осетр. На территории муниципального образования Лопхаринское расположен Куноватский заказник, в котором гнездится белый журавль - стерх, занесенный в Красную книгу Российской Федерации. Здесь единственное в мире месте, где стерхи гнездятся самостоятельно, без вмешательства людей. Изображение в гербе журавля указывает на уникальную особенность поселения.
Деление щита на голубую и зеленую части аллегорически показывает расположение всех населенных пунктов на берегах рек: Куноват и Большая Обь.
Сочетание голубого и зеленого цвета созвучно цветам герба Шурышкарского района и подчеркивает преемственность символики двух муниципальных образований.
Золото - символ богатства, стабильности, уважения и интеллекта.
Серебро - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания.
Зеленый цвет - символ природы, молодости, здоровья, жизненного роста.
Голубой цвет - символ чести, благородства, духовности, возвышенных устремлений.
Красный цвет - символ мужества, силы, труда, красоты и праздника.
Черный цвет - символ мудрости, скромности, вечности бытия.
Авторская группа:
идея герба: Администрация МО Лопхаринское, Константин Моченов (Химки);
художник компьютерный дизайн: Ольга Салова (Москва);
обоснование символики: Кирилл Переходенко (Конаково).

По материалам сайта Союза геральдистов России