Герб Чистоозерного района разработан Сибирской геральдической коллегией и утверждён Решением одиннадцатой сессии Совета депутатов Чистоозерного района первого созыва от 21 июня 2006 года. Герб внесен в Государственный геральдический регистр под №2441. Авторы герба: А.Ю.Журавков, А.В.Кошелев.

В лазоревом поле три летящие серебряные чайки (две и одна), сопровождаемые в оконечности тремя серебряными разновеликими поясами (верхним – узким, средним – равным по размеру двум верхним узким поясам и нижним – равным трем узким поясам. Щит может быть увенчан золотой территориальной короной установленного для муниципальных районов образца".

Использованы материалы сайта Сибирской геральдической коллегии; рисунок герба для "Геральдикума" подготовлен Ю.Калинкиным (г.Долгопрудный)