Герб Черноголовки утвержден в 1993 году, в центре композиции изображена уникальная "тройниковая" сосна

Использованы материалы статьи И.Сметанникова в журнале "Гербовед" №7

Положение о гербе муниципального образования "Поселок Черноголовка" принято решением Совета депутатов МО поселок Черноголовка №9/24 27 марта 2001 года. Герб внесен в Государственный геральдический регистр РФ под № 690. Согласно тексту Положения:

"3. Геральдическое описание и символа герба муниципального образования "Поселок Черноголовка"
3.1. Геральдическое описание герба муниципального образования "Поселок Черноголовка" гласит: " В рассеченном серебром и чернью поле лазоревый (синий, голубой) гонт, обремененный червленым (красным) деревом со стволом, расходящимся натрое и зеленой кроной, стоящим на зеленой оконечности гонта. Гонт, оконечность и дерево тонко окаймлены золотом. В вольной части - герб Московской области".
Герб может существовать в двух равноправных версиях:
полной - с вольной частью;
упрощенной - без вольной части.
3.2. Описание символики муниципального образования "Поселок Черноголовка":
В черном цвете содержится намек на название Черноголовки. Бело-черная основа герба символизирует противоположность света познания мраку невежества и символизирует присутствие науки на черноголовской территории.
Тройниковая сосна, расположенная в Черноголовке на обочине исторического Стромынского тракта, является местной природной достопримечательностью и указывает на обилие лесов в окрестностях Черноголовки. Вместе с тем, дерево вносит в герб дополнительный оттенок, являясь древнейшим символом цивилизации (Древо познания, Древо жизни и т.д.), образом развития, отражающим целостный взгляд на мир.
Черный цвет символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность и вечность бытия.
Серебро в геральдике - символ чистоты, мудрости, благородства, мира, взаимосотрудничества.
Голубой цвет в геральдике - символ красоты, чести, славы, преданности, истины, добродетели и чистого неба.
Красный цвет - символ жизнеутверждающей силы, энергии и красоты.
Зеленый цвет - символ весны, радости, надежды, жизни, природы, а также символ здоровья.
Золото в геральдике символизирует прочность, величие, интеллект, великодушие, богатство.
3.3. Автор герба: Лев Распопов (п. Черноголовка). Геральдическая доработка: Константин Моченов (г. Химки). Компьютерный дизайн: Сергей Исаев (г. Москва)".

Использованы материалы сайта "Местные новости" Черноголовки
Изображение герба из книги К.Моченова "Официальные символы Подмосковья"

В 2010 году Геральдический совет при президенте РФ одобрил специальную разновидность корон для гербов "наукоградов" - на каждом зубце такой короны вырез в виде раскрытой книги. Так как Черноголовка имеет статус наукограда, то возможно использование герба именно с такой короной.

Летом 2016 года во время урагана знаменитая трехглавая сосна в Черноголовке упала. В связи с этим в Черноголовке появились желающие изменить герб и изобразить на нем, например, ласточек.