Герб Баганского района утверждён Решением Территориального совета депутатов Баганского района от 23 декабря 2002 года, а затем повторно утверждён Решением № 14 Совета депутатов Баганского района от 29 декабря 2004 года (исправлен Решением Совета депутатов Баганского района от 26.05.2005 №43). Авторы: Саженина Елена Николаевна, Кошелев А. В., Журавков А. Ю. Герб внесён в Государственный геральдический регистр под № 1773 в феврале 2005 года. Согласно тексту Положения о гербе:

Версия описания 29.12.2004 г.: "В зеленом щите золотой безант (шар) с черной летящей уткой, сопровождаемый по бокам двумя золотыми стилизованными колосьями, поставленными в столб.

Версия описания 26.5.2005 г.

"2. Геральдическое описание и обоснование символики герба
2.1. Геральдическое описание герба Баганского района:
Герб Баганского района представляет собой геральдический щит, в зеленом поле которого золотой безант (шар) с черной летящей уткой, сопровождаемый по бокам двумя золотыми стилизованными колосьями, поставленными в столб.
2.2. Обоснование символики герба Баганского района:
Зеленый цвет - символ надежды, изобилия, возрождения, жизненных сил, олицетворяет Кулундинскую степь, на просторах которой раскинулся Баганский район.
Золотой шар солнце, дающее тепло и жизнь всему живому, в гербе символизирует радушие и гостеприимство жителей района.
Летящая утка символизирует природное своеобразие района, его бесчисленные озера, многие из которых соленые, а также говорит о названии района. "Баган" в переводе с тюркского обозначает "топкое место".
Золотые колосья на зеленом поле символизируют развитое земледелие, составляющее основу экономики района.
2.3. Автор герба - Саженина Елена Николаевна (с. Баган).
Геральдическая доработка герба и положения о гербе - Кошелев А.В., Журавков А. Ю. (г.Новосибирск)".

Использованы материалы сайта Сибирской геральдической коллегии; рисунок герба для "Геральдикума" подготовлен Ю.Калинкиным (г.Долгопрудный)